public class BattlePlace : MonoBehaviour {
public bool isActiv;
public GameObject inThisPlace;
private MeshRenderer mesh;
GameObject battleField { set; get; }
public int iThis;
public int jThis;
void OnMouseEnter()
{
isActiv = true;

}

void OnMouseExit()
{
isActiv = false;
}

// Use this for initialization
void Start () {
isActiv = false;
inThisPlace = null;
}

Клетки эти создаются скриптом из другого, "пустого", объекта

public class BattleField : MonoBehaviour {
public int len;
public int weth;
public GameObject origBattlePlace; //Стандартная клетка
public GameObject player;
public GameObject[][] battleArray; //Собственно матрица-поле
// Use this for initialization
void Start () {
battleArray = new GameObject[len][];//Создаём матрицу
for (int i = 0; i < len; i++)
{
battleArray[i] = new GameObject[weth];
for (int j = 0; j < weth; j++)
{
battleArray[i][j] = origBattlePlace; // Присваиваем каждому элементу матрицы клон оригинала
Instantiate(battleArray[i][j]);// добавляем клетку на сцену
BattlePlace bp = battleArray[i][j].GetComponent<BattlePlace>();// используем вставленный в объект клетки скрипт BattlePlace
bp.iThis = i; // прописываем в клетке её координаты
bp.jThis = j;
battleArray[i][j].transform.position = new Vector3(10 + i * 5, 0.1F, 10 + j * 5);
}
}

}

Персонаж проверяет: на какой клетке он стоит и "записывает" себя в поле клетки inThisPlace

public class Character : MonoBehaviour
{
public GameObject me;
public GameObject battleField;
private BattleField bf;

// Use this for initialization
void Start()
{
bf = battleField.GetComponent<BattleField>();

}

// Update is called once per frame
void Update()
{
int currentI = (int)(transform.position.x - 10) / 5;
int currentJ = (int)(transform.position.z - 10) / 5;
for (int i = 0; i < bf.len; i++)
for (int j = 0; j < bf.len; j++)
{
BattlePlace bp = bf.battleArray[i][j].GetComponent<BattlePlace>();
if ((bp.iThis == currentI) && (bp.jThis == currentJ))
{ bp.inThisPlace = me; Debug.Log(bp.iThis); }
}
}
}