Сперва разберись, как будешь рисовать. Пользоваться PixtureBox (или как их там) крайне не советую - ресурсоемко и накладно. Это в том случае, если собираешься что-то двигать.
А о прозрачности и говорить не стоит. Советую (для начала) юнитов описывать как структуру. А обрабатывает ее пусть класс, да.
++
Кстати, то что собираешься делать не с помощью движка - дикий плюс. Даже не берись за них)
Лучше поищи как можно еще рисовать.
